Początki Katedry i Zakładu Toksykologii sięgają 1973 r., kiedy to w Instytucie Farmakodynamiki i Analityki Medycznej Śląskiej Akademii Medycznej utworzono Zakład Chemii Toksykologicznej, wyodrębniony z istniejącego Zakładu Farmakodynamiki i Toksykologii. Organizację i kierownictwo Zakładu powierzono doc. dr hab. inż. Tadeuszowi Jerzykowskiemu. Od stycznia 1974 r. prowadzone były zajęcia ze studentami Wydziału Farmaceutycznego z zakresu chemii toksykologicznej.

W 1979 r. Zakład Toksykologii wszedł w skład utworzonego zarządzeniem MZiOS Instytutu Bioanalizy i Badania Środowiska. W 1980 r. doc. Tadeusz Jerzykowski jako doradca w zakresie biochemii i toksykologii wyjechał na kontrakt do Libii, a opiekę naukową i dydaktyczną nad zakładem objęła doc. dr hab. n. med. Halina Sybirska (pracownik Katedry i Zakładu Medycyny Sądowej ŚAM). Od roku 1981 do 1984 doc. dr hab. n. med. Halina Sybirska pełniła formalnie obowiązki kierownika.

W 1984 r. zarządzeniem rektora ŚAM rozwiązano instytuty istniejące na Wydziale Farmaceutycznym, a w ich miejsce powołano katedry. Kierownictwo Katedry i Zakładu Toksykologii od 1 września 1984 r. powierzono dr hab. n. przyr. Jerzemu Kwapulińskiemu, który pierwszy rok pracy poświęcił głównie organizacji zakładu i stanowisk pracy. Prof. dr hab. Jerzy Kwapuliński kierował Katedrą do momentu odejścia na emeryturę, do 30.09.2010 r. W latach 2010-2016 funkcję kierownika Katedry pełniła dr hab. n. tech. Danuta Wiechuła.

Z dniem 1 lutego 2017 r. Katedra i Zakład Toksykologii została połączona z Zakładem Higieny, Bioanalizy i Badania Środowiska tworząc nową jednostkę Katedrę i Zakład Toksykologii i Bioanalizy. Funkcję Kierownika Katedry pełni dr hab. n. med. Jerzy Stojko.